Secondo me è una specie di reskin o quasi perché se lanci un download da app xbox trovi la stessa barra di avanzamento nello store MS. E se non lanci l'app, il dowload prosegue tranquillamente da store. A meno che, come dici tu, non siano due app davvero separate tra loro che si "scambiano" informazioni sui download in corso... ad ogni modo nel mio caso i problemi restano.

E ti auguro di non dover mai formattare il PC perché le cartelle dei giochi che hai scaricato saranno semplicemente carta straccia per lo store (non riconosce i file precendentemente scaricati come avviene su Steam).