Joanna Lannister potrebbe essere stata l'amante di Aerys, c'erano diverse voci in proposito, ma prima del matrimonio con Tywin e quindi una decina d'anni prima della nascita di Tyrion.
Tywin ce l'aveva a morte con Aerys per un sacco di motivi, fra cui avergli fregato l'erede facendolo entrare nella Kingsguard. Durante la ribellione non ha cambiato bandiera, semplicemente non si è schierato fino all'ultimo perché il re aveva Jaime come ostaggio.
"Tu non sei mio figlio" non significa niente. A parte che Tywin lo dice anche a Jaime, se avesse saputo che Tyrion era figlio di Aerys lo avrebbe fatto ammazzare nella culla. Il che non vuol dire che non sia vero, eh, ma in ogni caso Tywin non l'avrebbe saputo.
Comunque per me l'obiezione più grossa a questa teoria, a parte il fatto che per me è molto più interessante che il nano sia figlio di Tywin ma sono opinioni, è che anche se fosse vera non ci sarebbe nessuno in grado di rivelarla, né a Tyrion né ai lettori. Penso che Martin lascerà la questione in sospeso.