C'è un settore nel disco dove vengono scritte le istruzioni di boot, o avvio.
Non si tratta di file che puoi manipolare.
La chiavetta, il dvd o il floppy che sia vanno formattati in una maniera apposita per renderli "bootable" cioè avviabili.
Rufus è un programma piccolo, gratuito e semplice che uso da anni. Riconosce il tipo di immagine che sia win o linux o altri e formatta in maniera appropriata aggiungendo il boot record.
Ci sono anche metodi a riga di comando ma se non li usi quotidianamente tendi a dimenticarli come il sottoscritto