Questa edizione del gioco includerà cinque pacchetti di skin e due texture pack per aumentare il grado di personalizzazione, inoltre si potrà sfruttare il touchscreen inferiore per controllare la mappa e gestire l’inventario.
Minecraft sarà compatibile esclusivamente con i dispositivi della famiglia New Nintendo 3DS (quindi anche l’ultimo arrivato, il New Nintendo 2DS). Sarà disponibile a breve sull’eShop, mentre la versione retail arriverà in una data successiva.